有南京到马来西亚槟城直达的飞机吗？

这你错了。不一定要在吉隆坡
南航国航和和泰航等等都有在国内转机的
路线这几个你可以参考一下
大概你也是要来USM读语言的吧
亚航：最便宜的，你可以买上海飞吉隆坡然后槟城，同一航班和机场方便，但问题是你第一次飞的话就比较麻烦，如果英语不好再加上你没有拿学生签证过关要有许多问题得跟海关解释
南航：比较便宜，南航联程机票：南京或南京周围的其他机场 飞广州再飞槟城
优点就是入境就是在槟城，不用再在马来西亚境内倒腾，有人接的话就更放心，好歹有个照顾
国泰国航和泰航马航等等都有在国内转机然后再直飞槟城的飞机，但通常的话机票都会贵于上面那个航空公司。

然后还有一些组合票，也非常便宜
最便宜的路线应该是，春秋 上海飞香港或澳门，然后再买亚航的香港到槟城，相当便宜
重点：随意搭配航班就只要抓住 国内转机的话，广州深圳香港澳门这四个地方的话就都有直飞航班可以到槟城。第一次入境尽量避开在吉隆坡或马来西亚泰国的其他地方转机